https://impilo.diploide.net/ 2026-05-01T17:21:44+00:00 https://impilo.diploide.net/ https://impilo.diploide.net/lib/exe/fetch.php?media=wiki:logo.png text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:adv_tree_structure&rev=1622316955&do=diff Installation avancée avec modifications au système de fichiers Introduction L'installation de base est un bon point de départ si vous voulez vous familiariser avec un serveur virtuel Linux; cependant, avec un usage plus intensif vous serez rapidement limité par certaines contraintes, principalement au niveau du stockage. La solution est facile: simplement mettre des composantes du système de fichiers Unix dans des disques virtuels distincts. text/html 2021-05-29T19:35:54+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:apache_config_impilo&rev=1622316954&do=diff Hôte virtuel Apache pour Impilo NOTE: Mise à jour pour Ubuntu 18.04 Idéalement, toute la documentation d'Impilo est basé sur du contenu Web, centralisé à un seul endroit qui est spécifique à Impilo. Pour permettre à un serveur Impilo de redéployer un matériel alternatif, j'ai crée un profil de serveur virtuel pour Apache selon la procédure suivante: text/html 2025-05-22T20:12:01+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:bin_app_select&rev=1747944721&do=diff Processus d'installation des applications bio-informatiques retrouvées dans Impilo Impilo a comme but premier de rendre disponible sur un seul serveur le plus grand nombre possible d'applications en bio-informatique tout en associant ces applications à une documentation pertinente pour une utilisation optimale et pour l'enseignement. text/html 2025-05-01T12:11:22+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:build_cycle&rev=1746101482&do=diff Le cycle de construction d'Impilo À chaque année, il existe dans mon calendrier deux dates qui ne peuvent être ignorer et qui me servent de balises dans le processus de construction d'Impilo: * Le jour de la St-Swithin, le 15 juillet, qui correspond également à text/html 2021-07-01T21:34:57+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:dev_app_select&rev=1625175297&do=diff Installation des environnements de développement présents dans Impilo Quoique le type de cours que j'enseigne ne demande à aucun moment aux étudiants de savoir programmer, je les incite fortement à se dégourdir et à apprendre au moins un language de programmation. Il faut également un minimum de composantes pour permetttre la compilation des applications à partir de leur code source. Dans le cadre du projet Impilo, j'ai décidé d'installer les environnements de développement des trois grands lan… text/html 2021-07-01T21:33:51+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:draw_app_select&rev=1625175231&do=diff Applications de graphisme présentes dans Impilo Impilo doit permettre à ses utilisateurs la création et l'édition de fichiers graphiques. Beaucoup de tâches en bio-informatique génèrent des images, qui doivent être mises en contexte pour présentation et publication. Ici, il faut mettre les meilleurs applications dans leur domaine. text/html 2021-05-29T19:35:54+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:gui_select&rev=1622316954&do=diff Installation de l'environnement graphique Introduction La sélection Xubuntu Minimal Installation lors de la création de la MV nous assure une système fonctionnel et pas trop alourdi par des extras... Une priorité pour le proche futur: concevoir un thème Impilo pour LightDM afin de supprimer toute ressemblance avec Xubuntu… J'ai choisi l'environnement graphique text/html 2021-07-01T21:34:39+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:internet_app_select&rev=1625175279&do=diff Applications des applications Internet présentes dans Impilo La bio-informatique sans l'Internet ne pourrait exister =) Par conséquent, Impilo doit contenir les applications capables de permettre la communication et l'acquisition de l'information nécessaire pour le travail du bio-informaticien. Cependant, pour garder encore une fois Impilo au plus spécifique, les applications de chat en tout genre reste à installer par l'utilisateur text/html 2021-07-01T21:34:19+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:office_app_select&rev=1625175259&do=diff Applications de bureautique présentes dans Impilo Impilo doit permettre à ses utilisateurs l'édition de fichiers texte et de fichiers de type tableur. Une fois de plus, nous sommes pris entre l'arbre et l'écorce quant au choix à faire: d'une part, Impilo voudrait resté une petite distro mais comme notre clientèle cible a besoin d'outils de pointe text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:sidebar&rev=1622316955&do=diff * À venir... text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:starting_point&rev=1622316955&do=diff Le point de départ... Voici nos raisonnements concernant la construction d'un serveur Impilo: * Utiliser l'approche “Machine virtuelle”. * Raison 1: la plupart des étudiants sont des néophytes et sont peu ou pas confortables à l'idée de démarrer leur ordis à l'aide du CD/DVD ou de construire un poste de travail à partir d'une machine physique vide; text/html 2025-06-01T11:48:52+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:tree_structure&rev=1748778532&do=diff Impilo - Installation de base Arborescence du système de fichiers pour Impilo Pour ne pas être trop “unique”, j'ai décidé de mettre tout le contenu spécifique à Impilo sous le répertoire /opt/bio; sous ce répertoire, vous trouverez les items suivants: text/html 2025-05-08T20:42:49+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:install:what_is_needed&rev=1746736969&do=diff Qu'est-ce que ça vous prend comme matériel pour réaliser une installation Impilo? Introduction Vous pouvez créer un serveur Impilo de deux manières différentes: * Soit en utilisant un ordinateur dédié qui deviendra alors un serveur Impilo, une solution plus appropriée pour quelqu'un qui fera de la bio-informatique sur une base régulière;