Impilo Central - fr:impilopedia:ht_sequencing:analysis_pipeline:qc_sequences https://impilo.diploide.net/ 2026-05-01T20:26:29+00:00 Impilo Central https://impilo.diploide.net/ https://impilo.diploide.net/lib/exe/fetch.php?media=wiki:logo.png text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) fastqc_usage https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:ht_sequencing:analysis_pipeline:qc_sequences:fastqc_usage&rev=1622316955&do=diff Évaluation de la qualité des fichiers de séquence FASTQ via FastQC Introduction FastQC <http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc> est un outil qui analyse les fichiers en format FASTQ pour résumer diverses propriétés de qualité, soit de manière textuelle, via un rapport en format texte, soit de manière visuelle via la construction d'un mini-site web contenant divers graphiques résumant la qualité des séquences d'un fichier. text/html 2024-03-11T16:32:40+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) qc_sequences https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:ht_sequencing:analysis_pipeline:qc_sequences:qc_sequences&rev=1710174760&do=diff Séquençage de nouvelle génération: évaluation de la qualité des fichiers de séquences brutes Introduction * Plus à venir... NOTE: Cette section s'applique autant à une expérience de séquençage pour assemblage de génome, recherche de nouveaux variants ou analyse d'expression par RNASeq.