https://impilo.diploide.net/ 2026-04-09T07:42:25+00:00 https://impilo.diploide.net/ https://impilo.diploide.net/lib/exe/fetch.php?media=wiki:logo.png text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:genex:microarrays:norm:affy_threestep&rev=1622316955&do=diff R/Bioconductor: Utilisation de la librairie affyPLM() pour la normalisation et la sommation Introduction La librairies affyPLM est à la base, une librairie pour la normalisation des données Affymetrix en utilisant des modèles basés sur l'intensité de sondes en addition à une normalisation RMA. La normalisation et la sommation se font via la méthode text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:genex:microarrays:norm:illumina_lumi&rev=1622316955&do=diff Normalisation des données Illumina via le package lumi Introduction * Imaginons que nous avons créer un objet ''LumiBatch'' appelé ''r.lumi''... * À suivre... Procédure Stabilisation de la variance Les données Illumina sont des données d'intensité lumineuse qui peuvent présenté de grande variance. Une manière de contrôler cette variance est de faire une transformation mathématique qui ramène les données d'une échelle non-linéaire à une échelle linéaire. La transformation classique est l… text/html 2021-05-29T19:35:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://impilo.diploide.net/doku.php?id=fr:impilopedia:genex:microarrays:norm:norm_main&rev=1622316955&do=diff Normalisation et sommation des données provenant des puces d'expression Introduction La normalisation est une procédure nécessaire afin de minimiser les variations expérimentales inter- ou intra-puces dans une expérience. La sommation est le traitement mathématique des différents signaux provenant des sondes pour un gène donné afin de les représenter par une seule valeur. Par exemple, un