Impilo - Installation de base

Pour ne pas être trop “unique”, j'ai décidé de mettre tout le contenu spécifique à Impilo sous le répertoire /opt/bio; sous ce répertoire, vous trouverez les items suivants:

• /opt/bio/data: Tout les fichiers de données biologiques pertinents pour l'utilisation des applications Impilo (par exemple, les fichiers des bases de données BLAST).
• /opt/bio/docs: Toute la documentation créée pour Impilo, incluant ce wiki. Consulter ces instructions pour la configuration Apache spécifique à cette MV.
• /opt/bio/sources: Où se trouvent toutes les applications bioinformatiques.

• Retirer le caractère de commentaire de cette ligne pour permettre l'utilisation des couleurs sur la console:

#force_color_prompt=yes

devient

force_color_prompt=yes

• Modifier ce bloc de sxh pour raccourcir l'affichage de la localisation dans le système de fichiers et enlever le vert comme couleur par défaut du prompt usager:

if [ "$color_prompt" = yes ]; then
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}[033[01;32m]u@\h[033[00m\]:[033[01;34m]w[033[00m]$ '
else
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\w\$ '
fi

devient

if [ "$color_prompt" = yes ]; then
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:[033[01;34m]W[033[00m]$'
else
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\W\$ '
fi

• En dernier, retirer le commentaire de cette ligne pour accentuer l'affichage du contenu filtré par grep:

#alias grep='grep --color=auto'

devient

alias grep='grep --color=auto'

• Après tout ceci, copier ce fichier sous /home/bioubuntu pour donner ces caractéristiques à l'usager bioubuntu. Tous les autres usagers l'auront par défaut.

• Retirer le caractère de commentaire de cette ligne pour permettre l'utilisation des couleurs sur la console:

#force_color_prompt=yes

devient

force_color_prompt=yes

• Modifier ce bloc bash pour raccourcir l'affichage de la localisation dans le système de fichiers et enlever le vert comme couleur par défaut du prompt usager:

if [ "$color_prompt" = yes ]; then
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}[033[01;32m]u@\h[033[00m\]:[033[01;34m]w[033[00m]$ '
else
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\w\$ '
fi

devient

if [ "$color_prompt" = yes ]; then
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:[033[01;34m]W[033[00m]$'
else
    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\W\$ '
fi

• Après tout ceci, copier ce fichier sous /home/bioubuntu pour donner ces caractéristiques à l'usager bioubuntu. Tous les autres usagers l'auront par défaut.

Lorsqu'un usager se connecte à un serveur Ubuntu, le script qui crée la session pour cet usager lit les fichiers sous /etc/profile.d pour fixer certains paramètres de cette session, entre autre où trouver les applications disponibles. Pour garder la philosophie de garder Impilo pour lui-même, un fichier appelé /etc/profile.d/impilo.sh est créer pour y contenir les paramètres qui lui sont spécifiques:

% sudo touch /etc/profile.d/impilo.sh