Environnements de développement sélectionnés pour Impilo 20.04
Introduction
Comme la politique d'Impilo est de compiler autant que possible les applications de bio-informatique nécessaires, il est important d'avoir la bonne chaine d'outils pour la compilation. Prenez note:
- Perl 5.30, PHP 7.4.3 et Python 3.8.2 sont déjà installé en vertu de la sélection de l'item
LAMP Server
lors de l'installation initiale. - OpenJava JDK version 11 est installé de base;
- Python 2.7.18 est installé pour certaines applications via le package
python-all
; - Atom est utilisé comme éditeur de texte général avec GUI pour toutes les applications.
Procédure
- Les applications sont installés simplement:
% sudo apt -y install --no-install-recommends build-essential automake gfortran default-jdk bioperl python3-biopython git