SPAdes
Introduction
- SPAdes est un logiciel d'assemblage de novo de séquences obtenues par diverses méthodes de séquençage à haut débit, capable d'associer des séquences courtes (par ex.: Illumina) ou longues (par ex.: PacBio et Nanopore); il possède aussi des méthodes d'analyse métagénomique. (1)
Informations générales
Site web: http://ablab.github.io/spades/
License: GNU GPL v.2
Instructions d'installation
Instruction d'usage
- Plus à venir…
Références
(1)
Prjibelski, A., Antipov, D., Meleshko, D., Lapidus, A., & Korobeynikov, A., 2020. Using SPAdes De Novo Assembler. Curr. Prot. Bioinformatics, 70, e102.