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Piste : emboss

EMBOSS

EMBOSS

Introduction

La suite EMBOSS(1) est un ensemble d'outils capables d'effectuer une ensemble de tâches très diverses sur des séquences biologiques.

Informations générales

  • Le projet EMBOSS a épuisé son financement: cette situation a eu un impact majeur sur le fonctionnement/développement des outils du projet :-(
    • Mise à jour (14/07/2016): suite à un échange sur la liste de discussion, le site principal ci-dessus pointe maintenant vers le site FTP original contenant la dernière version du code source ;-)
    • Le code source est lentement migré vers GitHub: voir sur cette page. Cependant, dans le moment (06/2022), il n'y a pas d'archive téléchargeable mais le lien sur emboss.open-bio.org fonctionne.
    • Les applications EMBASSY sont maintenant disponibles sur ce site GitHub.
  • License: Les libraries AJAX et NUCLEUS sont sous GNU LGPL v.3; les applications EMBOSS sont sous GNU GPL v.3

Instructions d'installation

Version Impilo Version installée
Impilo 24.04 A25 6.6.0
Impilo 24.04 A24 6.6.0

Instructions d'usage

  • Un petit tutoriel est disponible via cet article, écrit par Mullan et Bleasby(1). Il date un peu mais la logique de base n'a pas changé de manière significative depuis cette époque :-)

Références

(1) :ref:mullan_lj_2002Mullan, L. J. & Bleasby, A., 2002. Short EMBOSS User Guide. Briefs Bioinform, 3, pp.92-94.

Instructions d'usage

  • Un petit tutoriel est disponible via cet article, écrit par Mullan et Bleasby(2). Il date un peu mais la logique de base n'a pas changé de manière significative depuis cette époque :-)

Références

(1) Rice, P., Longden, I. & Bleasby, A., 2000. EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite.. Trends in Genetics, 16, pp.276-277.
(2) Mullan, L. J. & Bleasby, A., 2002. Short EMBOSS User Guide. Briefs Bioinform, 3, pp.92-94.
fr/install/bin_app_repository/emboss.txt · Dernière modification : 2025/05/01 14:41 de foisys
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