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Piste : jellyfish_231

Installation de Jellyfish 2.3.1

Installation de Jellyfish 2.3.1

Libraries additionnelles

Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire.

Procédure

  • Il faut aller chercher le code source sur GitHub:

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases/download/v2.3.1/jellyfish-2.3.1.tar.gz
% sudo tar -zxvf jellyfish-2.3.1.tar.gz
% sudo rm -rf jellyfish-2.3.1.tar.gz

  • Il faut s'assurer que le répertoire jellyfish-2.3.1 appartient à root avec les bonnes permissions:

% sudo chown -R root:root ./jellyfish-2.3.1
% sudo chmod 755 ./jellyfish-2.3.1

  • On procède à la compilation grâce au ballet habituel:

% cd jellyfish-2.3.1
% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install

  • Pour accéder au programme, on modifie le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour y ajouter les lignes suivantes:

#
# Bedtools specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jellyfish-2.3.1/bin

fr/install/bin_app_repository/24_04_a25_build/jellyfish_231.txt · Dernière modification : 2025/05/19 07:34 de foisys
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