Installation de FASTA 36.3.8i
Librairies additionnelles
Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire.
Procédure
Voici la procédure suivi pour l'installation de FASTA à partir du code source:
- L'archive du code source est téléchargée et décompressée sous
/opt/bio/sources
:
% cd /opt/bio/sources % sudo curl -L -O https://github.com/wrpearson/fasta36/archive/refs/tags/v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz % sudo tar -zxvf v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz % sudo rm v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
- Le dossier
fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020
devrait appartenir àroot
. Les permissions de ce dossier devraient être755
.
% sudo chown -R root:root ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 % cd ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020
- Une fois qu'on se retrouve dans le dossier
fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020
, la compilation se fait facilement:
% cd ./src % sudo make -f ../make/Makefile.linux64 all
- Les applications dans
fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin
sont rendu disponibles globalement en modifiant le fichier/etc/profile.d/impilo.sh
en y ajoutant les lignes suivantes :
# # FASTA specific environment variable # export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin