Installation de ViennaRNA Package 2.5.1
Librairies additionnelles
Aucune librairie supplémentaire n'est nécessaire pour cette installation.
Procédure
Voici la procédure suivi pour l'installation de ViennaRNA Package à partir du code source:
- L'archive du code source a été téléchargé du site web sous
/opt/bio/sources/
et décompressé.
% cd /opt/bio/sources % sudo curl -L -O https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/download/sourcecode/2_5_x/ViennaRNA-2.5.1.tar.gz % sudo tar -zxvf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz % sudo rm -rf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz
- Ce dossier devrait appartenir à
root
. Les permissions de ce dossier devraient être755
.
% sudo chown -R root:root ./ViennaRNA-2.5.1 % sudo chmod 755 ./ViennaRNA-2.5.1
- Une fois qu'on se retrouve dans le dossier
./ViennaRNA-2.5.1
, la compilation se fait simplement:
% cd ./ViennaRNA-2.5.1 % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
- La commande
sudo make install
crée un répertoire/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin
qui contient les exécutables; il faut éditer le fichier/etc/profile.d/impilo.sh
en y ajoutant ces lignes à la toute fin:
# # ViennaRNA Package specific environment variables # export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin