Installation de StringTie 2.2.1
Libraries
- Aucune librairie supplémentaire n'est nécessaire
Procédure
- On va chercher l'archive:
% cd /opt/bio/sources % sudo curl -L -o stringtie.2.2.1.tar.gz https://github.com/gpertea/stringtie/archive/refs/tags/v2.2.1.tar.gz % sudo tar -zxvf stringtie.2.2.1.tar.gz % sudo rm -rf stringtie.2.2.1.tar.gz
- Il faut s'assurer que le répertoire
stringtie-2.2.1
appartient àroot
avec les bonnes permissions:
% sudo chown -R root:root ./stringtie-2.2.1 % cd str
- On compile StringTie avec une variante de la valse habituelle:
% cd stringtie-2.2.1 % sudo make clean release
- La commande
make
installestringtie
directement sous/opt/bio/sources/stringtie-2.2.1
… Alors je crée un répertoirebin
et j'y mets un lien symbolique:
% sudo mkdir ./bin % sudo ln -s /opt/bio/sources/stringtie-2.1.3b/stringtie /opt/bio/sources/stringtie-stringtie-2.2.1/bin/stringtie
- On termine en modifiant le fichier
/etc/profile.d/impilo.sh
pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications:
# # StringTie specific environment variables # export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/stringtie-stringtie-2.2.1/bin