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Piste : ncbigenwork_382

Installation de NCBI Workbench 3.8.2

Installation de NCBI Workbench 3.8.2

Librairies additionnelles

  • Il faut installer les librairies suivantes:
    • libftgl2
    • libgl2ps1.4
    • libosmesa6
    • pristine-tar
    • xdelta
    • libxdelta2

% sudo apt-get install libftgl2 libgl2ps1.4 libosmesa6 pristine-tar xdelta libxdelta2

Procédure

  • Téléchargez le fichier .deb dans votre répertoire maison:

% curl -L -O https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/gbench/ver-3.8.2/gbench-ubuntu22.04-amd64-3.8.2-1.deb

  • Installer ncbigenomeworkbench via dpkg et effacer le fichier .deb:

% sudo dpkg -i gbench-ubuntu22.04-amd64-3.8.2-1.deb
% rm -rf gbench-ubuntu22.04-amd64-3.8.2-1.deb

  • Prenez note qu'il faut avoir modifier le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour que Genome Workbench puisse fonctionné. Comme vous voyez, il s'est installé sous /opt/ncbi donc hors de l'arborescence Impilo:

#
# NCBI Genome Workbench specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/ncbi/gbench-3.8.2/bin

  • Prenez note également que comme NCBI Genome Workbench est une application graphique, il faut être dans un desktop Xfce ou bien l'invoquer via un terminal X.
  • Pour effacer NCBI Genome Workbench, utilisez également dpkg:

% sudo dpkg --purge gbench-linux-Ubuntu-bionic_amd64-3.8.2.deb

fr/install/bin_app_repository/22_04_a23_build/ncbigenwork_382.txt · Dernière modification : 2023/06/20 09:21 de foisys
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