Installation de Infernal 1.1.4
Librairies additionnelles
Aucune librairie additionnelle est nécessaires.
Procédure
Voici la procédure suivi pour l'installation Prodigal à partir du code source:
- Il faut aller chercher l'archive du code source et compiler l'application sous
/opt/bio/sources
:
% cd /opt/bio/sources % sudo curl -L -O http://eddylab.org/infernal/infernal-1.1.4.tar.gz % sudo tar -zxvf infernal-1.1.4.tar.gz % sudo rm -rf infernal-1.1.4.tar.gz
- Ce dossier devrait appartenir à
root
. Les permissions de ce dossier devraient être755
.
% sudo chown -R root:root ./infernal-1.1.4 % sudo chmod -R 755 ./infernal-1.1.4
- Dès lors, la compilation se fait facilement:
% cd infernal-1.1.4 % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
- Il faut finalement modifier le fichier
/etc/profile.d/impilo.sh
pour que la ligne de commande puisse trouver l'application en y ajoutant ces lignes:
# # Infernal specific environment variables # export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/infernal-1.1.4/bin