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Les divers formats de données retrouvés en bio-informatique

Les divers formats de données retrouvés en bio-informatique

Introduction

Depuis maintenant des lustres, la biologie génère de résultats analogiques: photos, autoradiogrammes, chimiofluorescence, etc. Le changement de paradigme provoqué par les plateformes à haut débit à pousser les biologistes à passer au numérique: toutes, vraiment toutes, les plateformes à haut débit, moteurs du développement des -omiques, ne génèrent QUE des fichiers comme résultats bruts, qui ne se travaillent qu'en utilisant un ordinateur qui crée d'autres fichiers et ainsi de suite.

Il devient de première importance de connaitre le format de ces fichiers afin d'utiliser les bons outils pour les manipulés. D'aucune manière, nous cherchons à faire un répertoire exhaustif mais simplement une présentation des problématiques retrouvées et des solutions possibles.

foisys 2021/09/16 15:39

Formats fréquemment retrouvés

Formats de séquences biologiques

Formats de description des annotations de séquences

Formats de description structurale

Formats d'alignement de séquences

fr/impilopedia/dataformat/dataformat_main.txt · Dernière modification : 2021/09/16 15:40 de foisys
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