Environnements de développement sélectionnés pour Impilo 18.04

Comme la politique d'Impilo est de compiler autant que possible les applications de bio-informatique nécessaires, il est important d'avoir la bonne chaine d'outils pour la compilation. Prenez note:

• Perl 5.26, PHP 7.2.3 et Python 3.6.5 sont déjà installé en vertu de la sélection de l'item LAMP Server lors de l'installation initiale;
• Java version 8 est installé pour permettre la compatibilité avec certaines applications bio-informatiques;
• Python 3 est la version installée par défaut.
• Jedit est utilisé comme éditeur de texte général avec GUI pour toutes les applications.

• Les applications sont installés simplement:

% sudo apt-get -y --no-install-recommends install build-essential automake gfortran openjdk-8-jdk perl bioperl python3 python-biopython jedit

• Voici le contenu du fichier develop_module.txt utilisé pour la construction d'Impilo 18.04:

#
# Developer's tools for Impilo
#
build-essential
automake
gfortran
openjdk-8-jdk
bioperl
python-biopython
jedit