HMMER3 est l'application par excellence dans l'application des principes des modèles de Markov cachés (voir
ici et
ici). Cette vision est la plus récente, accélérée en utilisant des attributs de vectorization construits à même les processeurs avec une architecture x86_64;
elle ne pourra pas s'installer sur un ordinateur ARM comme le Raspberry Pi . Sur le RPi, utiliser plutôt
HMMER2.