Table des matières
Fastp
Introduction
Informations générales
Instructions d'installation
Instruction d'usage
Références
Fastp
Introduction
Fastp est un logiciel combinant analyse de la qualité et filtrage des séquences pour les fichiers provenant des applications de séquençage de nouvelle génération tel Illumina
(1,
2)
.
Informations générales
Site web:
https://github.com/OpenGene/fastp
License:
MIT License
Instructions d'installation
Version Impilo
Version installée
Impilo 24.04 A25
0.24.1
Instruction d'usage
Les procédures d'utilisation détaillées se trouvent à
https://github.com/OpenGene/fastp
Références
(1,
Chen, S., Zhou, Y., Chen, Y. & Gu, J., 2018.
fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor.
Bioinformatics
, 34, i884–i890.
2)
Chen, S., 2023.
Ultrafast one-pass FASTQ data preprocessing, quality control, and deduplication using fastp.
iMeta
, 2, e107.