Table des matières
EMBOSS
Introduction
La suite EMBOSS(1) est un ensemble d'outils capables d'effectuer une ensemble de tâches très diverses sur des séquences biologiques.
Informations générales
- Site web: http://emboss.open-bio.org
- Le projet EMBOSS a épuisé son financement: cette situation a eu un impact majeur sur le fonctionnement/développement des outils du projet
- Mise à jour (14/07/2016): suite à un échange sur la liste de discussion, le site principal ci-dessus pointe maintenant vers le site FTP original contenant la dernière version du code source
- Le code source est lentement migré vers GitHub: voir sur cette page. Cependant, dans le moment (06/2022), il n'y a pas d'archive téléchargeable mais le lien sur emboss.open-bio.org fonctionne.
- Les applications EMBASSY sont maintenant disponibles sur ce site GitHub.
- License: Les libraries AJAX et NUCLEUS sont sous GNU LGPL v.3; les applications EMBOSS sont sous GNU GPL v.3
Instructions d'installation
| Version Impilo | Version installée |
|---|---|
| Impilo 24.04 A25 | 6.6.0 |
Instructions d'usage
- Un petit tutoriel est disponible via cet article, écrit par Mullan et Bleasby(2) date un peu mais la logique de base n'a pas changé de manière significative depuis cette époque
Références
(1)
Rice, P., Longden, I. & Bleasby, A., 2000. EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite.. Trends in Genetics, 16, pp.276-277.
(2)
Mullan, L. J. & Bleasby, A., 2002. Short EMBOSS User Guide. Briefs Bioinform, 3, pp.92-94.