Table des matières

CLUSTAL OMEGA

CLUSTAL OMEGA

Introduction

Clustal Omega est une version améliorée de ClustalW, utilisant des profils HMM pour améliorer autant les performances en précision qu'en vitesse(1,2).

Informations générales

Site web: http://www.clustal.org

License: GNU GPL v.2

Instructions d'installation

Version Impilo	Version installée
Impilo 24.04 A25	1.2.4
Impilo 24.04 A24	1.2.4

Instructions d'usage

D. R. Higgins est l'auteur d'un chapitre du répertoire de protocoles en bioinformatique Current Protocols in Bioinformatics:
- Clustal Omega (3)

Références

(1, F. Sievers, A. Wilm, D. Dineen, T. J. Gibson, K. Karplus, W. Li, R. Lopez, H. McWilliam, M. Remmert, J. Söding, J. D. Thompson and D. G. Higgins, 2011. Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega. Mol. Syst. Biol., 7, pp.539.

2) F. Sievers and D. G. Higgins, 2018. Clustal Omega for making accurate alignments of many protein sequences. Protein Sci., 27, pp.135-145.

(3) F. Sievers and D. G. Higgins, 2014. Clustal Omega. Curr. Protoc. Bioinformatics, 48, pp.3.13.1-3.13.16.