Installation de T-COFFEE 13.45.0

Aucune librairie additionnelle est nécessaire.

Voici la procédure suivi pour l'installation de T-COFFEE à partir du code source:

• On doit aller chercher l'archive du code source et la décompress.:

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O https://s3.eu-central-1.amazonaws.com/tcoffee-packages/Stable/Latest/T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64.tar.gz
% sudo tar -zxvf T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64.tar.gz
% sudo rm -rf T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64.tar.gz

• Les permissions devraient être déjà en place mais simplement vérifier: le dossier T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64 devrait appartenir à root et ces permissions devraient être 755. Si non, alors faites comme ça:

% sudo chown -R root:root ./T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64
% sudo chmod 755 ./T-COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64

• Pour que tous puissent l'utiliser, il faut ajouter les lignes suivantes au fichier /etc/profile.d/impilo.sh:

#
# T-COFFEE specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/13.46.0.919e8c6b_linux_x64/bin