Installation de FASTA 36.3.8i

Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire.

Voici la procédure suivi pour l'installation de FASTA à partir du code source:

• L'archive du code source est téléchargée et décompressée sous /opt/bio/sources:

 
% cd /opt/bio/sources 
% sudo curl -L -O https://github.com/wrpearson/fasta36/archive/refs/tags/v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
% sudo tar -zxvf v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
% sudo rm v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz

• Le dossier fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 devrait appartenir à root. Les permissions de ce dossier devraient être 755.

 % sudo chown -R root:root ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 
% cd ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 

• Une fois qu'on se retrouve dans le dossier fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020, la compilation se fait facilement:

 
% cd ./src 
% sudo make -f ../make/Makefile.linux64 all 

• Les applications dans fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin sont rendu disponibles globalement en modifiant le fichier /etc/profile.d/impilo.sh en y ajoutant les lignes suivantes :

 
# 
# FASTA specific environment variable 
# 
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin