Installation de ViennaRNA Package 2.5.1

Aucune librairie supplémentaire n'est nécessaire pour cette installation.

Voici la procédure suivi pour l'installation de ViennaRNA Package à partir du code source:

• L'archive du code source a été téléchargé du site web sous /opt/bio/sources/ et décompressé.

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/download/sourcecode/2_5_x/ViennaRNA-2.5.1.tar.gz
% sudo tar -zxvf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz
% sudo rm -rf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz

• Ce dossier devrait appartenir à root. Les permissions de ce dossier devraient être 755.

% sudo chown -R root:root ./ViennaRNA-2.5.1
% sudo chmod 755 ./ViennaRNA-2.5.1

• Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ./ViennaRNA-2.5.1, la compilation se fait simplement:

% cd ./ViennaRNA-2.5.1
% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install

• La commande sudo make install crée un répertoire /opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin qui contient les exécutables; il faut éditer le fichier /etc/profile.d/impilo.sh en y ajoutant ces lignes à la toute fin:

#
# ViennaRNA Package specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin