Installation de StringTie 2.2.1

• Aucune librairie supplémentaire n'est nécessaire

• On va chercher l'archive:

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o stringtie.2.2.1.tar.gz  https://github.com/gpertea/stringtie/archive/refs/tags/v2.2.1.tar.gz
% sudo tar -zxvf stringtie.2.2.1.tar.gz
% sudo rm -rf stringtie.2.2.1.tar.gz

• Il faut s'assurer que le répertoire stringtie-2.2.1 appartient à root avec les bonnes permissions:

% sudo chown -R root:root ./stringtie-2.2.1
% cd str

• On compile StringTie avec une variante de la valse habituelle:

% cd stringtie-2.2.1
% sudo make clean release

• La commande make installe stringtie directement sous /opt/bio/sources/stringtie-2.2.1… Alors je crée un répertoire bin et j'y mets un lien symbolique:

% sudo mkdir ./bin
% sudo ln -s /opt/bio/sources/stringtie-2.1.3b/stringtie /opt/bio/sources/stringtie-stringtie-2.2.1/bin/stringtie

• On termine en modifiant le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications:

#
# StringTie specific environment variables
#
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/stringtie-stringtie-2.2.1/bin