Installation de Jmol 16.1

Java, déjà installé.

Voici la procédure suivi pour l'installation de Jmol:

• Jmol est distribué sous la forme d'une archive JAR, prêt à exécuter via un script de démarrage:

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o jmol-16.1.13.gz https://sourceforge.net/projects/jmol/files/latest/download 
% sudo unzip jmol-16.1.13.gz
% sudo rm jmol-16.1.13.gz

• Ce dossier devrait appartenir à root. Les permissions de ce dossier devraient être 755.

% sudo chown -R root:root ./jmol-16.1.13
% sudo chmod 755 ./jmol-16.1.13

• Une fois qu'on se retrouve dans le dossier /opt/bio/sources/jmol-16.1.13, il faut simplement copier le fichier jmol.sh vers runJMol et rendre ce dernier exécutable.

% sudo cp jmol.sh runJMol
% sudo chmod +x runJMol

• Afin de rendre jmol disponible pour tous, il faut éditer le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour y ajouter à la toute fin les lignes suivantes:

#
# JMol specific environment variable
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jmol-16.1.13

• Pour ajouter Jmol dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
  • Plus à venir…