Installation de Infernal 1.1.4

Aucune librairie additionnelle est nécessaires.

Voici la procédure suivi pour l'installation Prodigal à partir du code source:

• Il faut aller chercher l'archive du code source et compiler l'application sous /opt/bio/sources:

% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O http://eddylab.org/infernal/infernal-1.1.4.tar.gz
% sudo tar -zxvf infernal-1.1.4.tar.gz
% sudo rm -rf infernal-1.1.4.tar.gz

• Ce dossier devrait appartenir à root. Les permissions de ce dossier devraient être 755.

% sudo chown -R root:root ./infernal-1.1.4
% sudo chmod -R 755 ./infernal-1.1.4

• Dès lors, la compilation se fait facilement:

% cd infernal-1.1.4
% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install

• Il faut finalement modifier le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour que la ligne de commande puisse trouver l'application en y ajoutant ces lignes:

#
# Infernal specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/infernal-1.1.4/bin