Installation de HMMER 3.3.2

• Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire

• On va chercher l'archive:

 
% cd /opt/bio/sources 
% sudo curl -L -O http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer.tar.gz 
% sudo tar -zxvf hmmer.tar.gz 
% sudo rm -rf hmmer.tar.gz

• Il faut s'assurer que le répertoire hmmer-3.3.2 appartient à root avec les bonnes permissions:

 
% sudo chown -R root:root ./hmmer-3.3.2 
% sudo chmod 755 ./hmmer-3.3.2 

• On compile HMMER avec la valse habituelle:

 
% cd hmmer-3.3.2
% sudo ./configure –prefix=`pwd` 
% cd easel && sudo make install 
% cd ../ && sudo make 
% sudo make check 
% sudo make install 

• On termine en modifiant le fichier /etc/profile.d/impilo.sh pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications:

 
# 
# HMMER specific environment variables 
# 
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/hmmer-3.3.2/bin