La normalisation est une procédure nécessaire afin de minimiser les variations expérimentales inter- ou intra-puces dans une expérience. La sommation est le traitement mathématique des différents signaux provenant des sondes pour un gène donné afin de les représenter par une seule valeur. Par exemple, un probeset Affymetrix est une collection de sondes PM et MM qui chacune procure un signal que l'algorithme de sommation traitera pour ne produire qu'une seule valeur d'expression pour ce probeset.