Gestion des informations bibliographiques avec Zotero

Il est inutile de souligner à quel point la biologie est une science (tout comme la chimie et la physique) qui dépend du travail d'une multitude de chercheurs. Tout ce travail se manifeste sous la forme d'articles publiés dans des journaux spécialisés qui par la suite nous servent à construire notre propre recherche: nouvelles hypothèses, matériels et méthodes utilisés, etc. Il devient essentiel de gérer une multitude de sources documentaires; ces sources nous servent à faire notre recherche et c'est notre devoir de les citer lorsque nous les utilisons.

Donc, comment faire? Les logiciels de gestion des sources bibliographiques existent depuis très longtemps (souvenirs d'écriture de thèse avec EndNote 2 dans les années 90…) et leur intégration avec les logiciels de traitement de texte depuis au moins aussi longtemps. Il en existe toute une variété: EndNote, Reference Manager, Papyrus, Papers et plus encore. Cependant, Impilo est construit sur l'utilisation de logiciels à code source libre donc une solution respectant cette philosophie est nécessaire Après en avoir essayer plusieurs, notre choix s'est porté sur le plus complet: Zotero.

Zotero procure tous les attributs recherchés:

• Il peut extraire les sources bibliographiques à partir de pages Web;
• Il gère les références et leurs fichiers associés tels que les versions électroniques en PDF;
• Il permet le partage des références pour le travail de groupe;
• Il s'intègre avec les logiciels de traitement de texte;
• Il peut accéder à une vaste librairie de formats bibliographiques.
• Il est gratuit;
• Il est à code source ouvert.

• Tout simple: aller sur cette page et simplement cliquer le bouton Download dans le panneau de gauche. La page web est suffisamment intelligente pour vous offrir de télécharger la version compatible avec le système d'opération sur lequel vous roulez votre fureteur.
  • Vous avez également la possibilité de télécharger une version pour un autre système d'opération si nécessaire.

• Il faut simplement double-cliquer l'icône du fichier téléchargé et suivre les instructions pour l'installation.

• Ce module est une nécessité pour automatiser la capture d'informations contenues dans une page web; son installation va de pair avec l'installation de l'application elle-même.
• Il existe deux versions de ce module: une version Firefox et une version Chrome. Encore une fois, la page web a l'intelligence de détecter le fureteur que vous utilisez et de vous proposez le bon module à installer dans la panneau de droite de la même page.
  • Il existait un module pour Safari mais il a rejoint le dodo dans l'extinction… Et il faut en blâmer Apple
• Le processus d'installation varie évidemment mais vous saurez que cela à fonctionner si vous voyez apparaitre une icône dans la barre de l'URL qui ressemble à une feuille de papier au coin supérieur droit replié:
  • Pour Chrome:

• Pour Firefox:

• Plus à venir…

• Pour continuer, nous assumons les informations suivantes:
  • Vous avez installé Zotero et il fonctionne;
  • Vous avez également installé les modules de capture de référence (en jargon, les browser extensions) pour votre fureteur.

• Plus à venir…