====== NCBI SRA Toolkit ====== ===== Introduction ===== La suite de logiciels SRA Toolit du NCBI permet d'obtenir les fichiers de la base de données //Sequence Read Archive// du NCBI et d'en extraire les fichiers sous diverses formes, incluant en format FASTQ. ===== Informations générales ===== Site web: [[https://github.com/ncbi/sra-tools|https://github.com/ncbi/sra-tools]] License: [[https://spdx.org/licenses/NCBI-PD.html|NCBI Public Domain]] avec [[https://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.en.html|GNU Lesser General Public License]] et inspiré par BSD pour certains fichiers permettant l'utilisations des fichiers en format VDB. ===== Instructions d'installation ===== ^ Version Impilo ^ Version installée | ^ Impilo 24.04 A25 | [[.:25_04_a25_build:sratoolkit_321|3.2.1]] | ^ Impilo 24.04 A24 | [[.:24_04_a24_build:sratoolkit_311|3.1.1]] | ===== Instruction d'usage ===== * Le [[https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki|site wiki sur GitHub]] contient pas mal d'infos sur l'usage de la suite SRA Toolkiy ===== Références ===== * À venir...