====== SPAdes ====== ===== Introduction ===== * SPAdes est un logiciel d'assemblage //de novo// de séquences obtenues par diverses méthodes de séquençage à haut débit, capable d'associer des séquences courtes (par ex.: Illumina) ou longues (par ex.: PacBio et Nanopore); il possède aussi des méthodes d'analyse métagénomique. [(prjibelski_a_2020)] ===== Informations générales ===== Site web: [[http://ablab.github.io/spades/|http://ablab.github.io/spades/]] License: [[https://www.gnu.org/licenses/old-licenses/gpl-2.0.en.html|GNU GPL v.2]] ===== Instructions d'installation ===== ^ Version Impilo ^ Version installée | ^ Impilo 24.04 A25 | [[.:24_04_a25_build:spades_410|4.1.0]] | ^ Impilo 24.04 A24 | [[.:24_04_a24_build:spades_400|4.0.0]] | ===== Instruction d'usage ===== * Plus à venir... ===== Références ===== notes-separator : none