====== FASTA ====== ===== Introduction ===== * FASTA [(:pearson_wr_1988)][(:pearson_wr_1996)][(:pearson_wr_1997)][(:pearson_wr_2000)] est un des plus anciens programmes d'alignement de séquences //pairwise// par heuristique et un des premiers à avoir introduit la notion de signification statistique dans l'évaluation des alignements obtenus. ===== Informations générales ===== * Site web: [[http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml| http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml]] * License: [[https://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0|Apache License, v.2]] ===== Instructions d'installation ===== ^ Version Impilo ^ Version installée | ^ Impilo 24.04 A25 | [[.:24_04_a25_build:fasta3638i|36.3.8i]] | ^ Impilo 24.04 A24 | [[.:24_04_a24_build:fasta3638i|36.3.8i]] | ===== Instructions d'usage ===== * W. R. Pearson est l'auteur de deux chapitres du répertoire de protocoles en bioinformatique //Current Protocols in Bioinformatics//: * //Finding Protein and Nucleotide Similarities with FASTA// [(:pearson_dr_2016)] * //Selecting the Right Similarity-Scoring Matrix// [(:pearson_dr_2013)] ===== Références ===== notes-separator : none