====== Installation de FASTA 36.3.8i ======


===== Librairies additionnelles =====

Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire.

===== Procédure =====

Voici la procédure suivi pour l'installation de FASTA à partir du code source:

  * L'archive du code source est téléchargée et décompressée sous ''/opt/bio/sources'':
<sxh bash> 
% cd /opt/bio/sources 
% sudo curl -L -O https://github.com/wrpearson/fasta36/archive/refs/tags/v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
% sudo tar -zxvf v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
% sudo rm v36.3.8i_14-Nov-2020.tar.gz
</sxh>

  * Le dossier ''fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020''  devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.

<sxh bash> % sudo chown -R root:root ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 
% cd ./fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020 
</sxh>

  * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020'', la compilation se fait facilement:

<sxh bash> 
% cd ./src 
% sudo make -f ../make/Makefile.linux64 all 
</sxh>

  * Les applications dans ''fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin''  sont rendu disponibles globalement en modifiant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  en y ajoutant les lignes suivantes :

<sxh bash> 
# 
# FASTA specific environment variable 
# 
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/fasta36-36.3.8i_14-Nov-2020/bin 
</sxh>