====== Installation de Artemis 18.2.0 ======

===== Librairies additionnelles =====

Java, déjà installé si vous avez [[fr:install:dev_app_select|suivi cette recette]]. Depuis cette nouvelle version d'Artemis, il existe une dépendance stricte à une version de Java supérieure à Java 8.

===== Procédure =====

Voici la procédure suivi pour l'installation des outils d'Artemis:

  * Il faut télécharger l'archive du site web et la décompresser sous ''/opt/bio/sources''. Vous trouverez un dossier nommé ''artemis''.

<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O https://github.com/sanger-pathogens/Artemis/releases/download/v18.2.0/artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz
% sudo tar -zxvf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz
% sudo rm -rf artemis-unix-release-18.2.0.tar.gz
</sxh>

  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.

<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./artemis
% sudo chmod 755 ./artemis
</sxh>

  * Il reste à rendre les outils d'Artemis disponible pour tous en éditant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  en y ajoutant à la toute fin les lignes suivantes:

<sxh bash>
#
# Artemis specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/artemis
</sxh>

  * Artemis devient accessible simplement avec la commande suivante:

<sxh bash>
% art
</sxh>

  * Pour ajouter les outils d'Artemis dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
      * Plus à venir…