====== Installation de Prodigal 2.6.3 ======

===== Librairies additionnelles ===== 

Aucune librairie additionnelle est nécessaires.

===== Procédure =====

Voici la procédure suivi pour l'installation Prodigal à partir du code source:

  * Il faut aller chercher l'archive du code source et compiler l'application sous ''/opt/bio/sources'':
<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o prodigal.v2.6.3.tar.gz https://github.com/hyattpd/Prodigal/archive/v2.6.3.tar.gz
% sudo tar -zxvf prodigal.v2.6.3.tar.gz
% sudo rm -rf prodigal.v2.6.3.tar.gz
</sxh>

  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./Prodigal-2.6.3
% sudo chmod -R 755 ./Prodigal-2.6.3
</sxh>

  * Dès lors, la compilation se fait facilement:
<sxh bash>
% cd Prodigal-2.6.3
% sudo make
</sxh>

  * On se simplifie l'existence:
<sxh bash>
% sudo mkdir ./bin
% sudo ln -s /opt/bio/sources/Prodigal-2.6.3/prodigal /opt/bio/sources/Prodigal-2.6.3/bin/prodigal
</sxh>


  * Il faut finalement modifier le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour que la ligne de commande puisse trouver l'application en y ajoutant ces lignes:
<sxh bash>
#
# Prodigal specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/Prodigal-2.6.3/bin
</sxh>