====== Installation de Jmol 16.1 ======

===== Librairies additionnelles ===== 

Java, déjà installé.

===== Procédure =====

Voici la procédure suivi pour l'installation de Jmol:

  * Jmol est distribué sous la forme d'une archive JAR, prêt à exécuter via un script de démarrage:

<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o jmol-16.1.13.gz https://sourceforge.net/projects/jmol/files/latest/download 
% sudo unzip jmol-16.1.13.gz
% sudo rm jmol-16.1.13.gz
</sxh>

  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.

<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./jmol-16.1.13
% sudo chmod 755 ./jmol-16.1.13
</sxh>

  * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''/opt/bio/sources/jmol-16.1.13'', il faut simplement copier le fichier ''jmol.sh'' vers ''runJMol'' et rendre ce dernier exécutable.
<sxh bash>
% sudo cp jmol.sh runJMol
% sudo chmod +x runJMol
</sxh>

  * Afin de rendre ''jmol'' disponible pour tous, il faut éditer le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour y ajouter à la toute fin les lignes suivantes:
<sxh bash>
#
# JMol specific environment variable
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jmol-16.1.13
</sxh>

  * Pour ajouter Jmol dans le menu des applications Impilo, il faut modifier le fichier de configuration de Xfce4:
    * Plus à venir...