====== Installation de Infernal 1.1.4 ======

===== Librairies additionnelles ===== 

Aucune librairie additionnelle est nécessaires.

===== Procédure =====

Voici la procédure suivi pour l'installation Prodigal à partir du code source:

  * Il faut aller chercher l'archive du code source et compiler l'application sous ''/opt/bio/sources'':
<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -O http://eddylab.org/infernal/infernal-1.1.4.tar.gz
% sudo tar -zxvf infernal-1.1.4.tar.gz
% sudo rm -rf infernal-1.1.4.tar.gz
</sxh>

  * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./infernal-1.1.4
% sudo chmod -R 755 ./infernal-1.1.4
</sxh>

  * Dès lors, la compilation se fait facilement:
<sxh bash>
% cd infernal-1.1.4
% sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
</sxh>

  * Il faut finalement modifier le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour que la ligne de commande puisse trouver l'application en y ajoutant ces lignes:
<sxh bash>
#
# Infernal specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/infernal-1.1.4/bin
</sxh>