====== Installation de Barrnap 0.9 ======

===== Libraries =====

  * Comme Perl est déjà installé, aucune librairie additionnelle n'est nécessaire 

===== Procédure =====

  * Le fonctionnement de Barrnap dépend de la présence d'un certain nombre d'applications:
    * Absolument nécessaires:
      * Perl (voir ci-dessus)
      * ''nhmmer'' (fourni par [[fr:install:bin_app_repository:hmmer|HMMER]])
      * [[fr:install:bin_app_repository:bedtools|Bedtools]]

  * Avant de poursuivre, il faut donc vous assurer d'avoir installé toutes ces applications en place et qu'ils sont dans le ''$PATH''.

  * Une fois cela complété, il vous faut faire les opérations suivantes:
<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o barrnap-0.9.tar.gz https://github.com/tseemann/barrnap/archive/0.9.tar.gz
% sudo tar -zxvf barrnap-0.9.tar.gz
% sudo rm barrnap-0.9.tar.gz
</sxh>

  * Il faut s'assurer que le répertoire ''barrnap-0.9'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions:
<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./barrnap-0.9
% sudo chmod 755 ./barrnap-0.9
</sxh>

  * On termine en modifiant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications:
<sxh bash>
#
# Barrnap specific environment variables
#
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/barrnap-0.9/bin
</sxh>