====== Pré-analyse : Alignements des séquences ======

===== Introduction =====

===== Protocole =====

==== Préparation d'un fichier d'ARN contaminants ====

La plupart de préparations d'ARN pour séquences seront contaminés avec de l'ARN ribosomique et/ou de l'ARN de transfert. Afin d'optimiser les alignements obtenus, il est désirable de les filter hors des alignements finaux. Cependant, comment créer le fichier de données pour l'aligneur?

  * [[fr:impilopedia:genex:rnaseq:align:contaminant_rna_file_creation_ucsc|Protocole utilisant les ressources du Genome Browser de UCSC]]