====== Lecture des fichiers de données BeadStudio d'Illumina ======

===== Introduction =====

La plateforme Illumina génère une série de fichiers contenant les données à l'échelle des billes elles-même ainsi que les images obtenues durant l'acquisition en tant que telle. Ces fichiers ne sont pas toujours rendu disponibles à l'usager final. Une autre possibilité est la création de fichiers résumant les signaux observés pour chaque sonde et/ou pour chaque gène d'une puce donnée; c'est le plus souvent de cette manière que l'usager obtiendra ces résultats.

Les notes suivantes sont largement inspirées des vignettes R/Bioconductor pour les librairies utilisées: ''beadarray'' et ''lumi''.

===== Procédures =====

  * Pour ''beadarray''

    * Comment lire les données brutes des billes?
    * [[fr:impilopedia:genex:acquire:illumina:beadarray:beadarray_summary|Comment lire les fichiers résumant les données brutes?]]

  * Pour ''lumi''
    * À venir...