Impilo Central

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====== Installation de HMMER 3.4 ======

===== Libraries =====

  * Aucune librairie additionnelle n'est nécessaire 

===== Procédure =====

  * On va chercher l'archive:

<sxh bash> 
% cd /opt/bio/sources 
% sudo curl -L -O http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer.tar.gz 
% sudo tar -zxvf hmmer.tar.gz 
% sudo rm -rf hmmer.tar.gz
</sxh>

  * Il faut s'assurer que le répertoire ''hmmer-3.4''  appartient à ''root''  avec les bonnes permissions:

<sxh bash> 
% sudo chown -R root:root ./hmmer-3.4 
% sudo chmod 755 ./hmmer-3.4 </sxh>

  * On compile HMMER avec la valse habituelle:

<sxh bash> 
% cd hmmer-3.4
% sudo ./configure –prefix=`pwd` 
% cd easel && sudo make install 
% cd ../ && sudo make 
% sudo make check 
% sudo make install </sxh>

  * On termine en modifiant le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh''  pour y mettre à la fin les infos sur la position des applications:

<sxh bash> 
# 
# HMMER specific environment variables 
# 
export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/hmmer-3.4/bin </sxh>