Impilo Central

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====== Installation de Fastp 0.24.1 ======

===== Libraries additionnelles =====

Les librairies suivantes sont nécessaires afin de compiler Fastp avec succès:
  * ''libdeflate-dev''
  * ''libisal-dev''

<sxh bash>
% sudo apt install --no-install-recommends libdeflate-dev libisal-dev
</sxh>

===== Procédure =====

  * Il faut aller chercher le code source sur GitHub:
<sxh bash>
% cd /opt/bio/sources
% sudo curl -L -o fastp.0.24.1.tar.gz https://github.com/OpenGene/fastp/archive/refs/tags/v0.24.1.tar.gz
% sudo tar -zxvf fastp.0.24.1.tar.gz
% sudo rm -rf fastp.0.24.1.tar.gz
</sxh>

  * Il faut s'assurer que le répertoire ''fastp-0.24.1'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions:
<sxh bash>
% sudo chown -R root:root ./fastp-0.24.1
% sudo chmod 755 ./fastp-0.24.1
</sxh>

  * On procède à la compilation grâce à la commande ''make''.
<sxh bash>
% cd fastp-0.24.1
% sudo make
</sxh>

  * Pour accéder au programme, on modifie le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' pour y ajouter les lignes suivantes:
<sxh bash>
#
# Fast specific environment variables
#
export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/fastp-0.24.1
</sxh>