Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:misc:distro_why [2019/01/17 13:03] – modification externe 127.0.0.1
+++ fr:misc:distro_why [2022/01/06 09:11] (Version actuelle) – foisys
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+====== Pourquoi s'évertuer à créer une distribution Linux pour la bio-informatique? ======
+Et c'est vraiment une très bonne question :-) Il existe pourtant déjà plusieurs efforts de distributions Linux ciblant la bio-informatique:
+  * [[http://www.dnalinux.com/|DNALinux]]
+  * [[http://envgen.nox.ac.uk/tools/bio-linux|NEBC Bio-Linux]]
+  * [[http://www.vigyaancd.org/|Vigyaan]]
+  * [[http://www.bioinformatics.org/vlinux/|VLinux]]
+Pourtant, en les analysant de près, la plupart ne peuvent répondre à nos besoins de formation à cause d'un ou plusieurs des points suivants:
+  * Dans plusieurs cas, les applications sont obsolètes ou sont des versions démodées d'applications usuelles.
+  * Certaines d'entre elles semblent plus dirigées vers une clientèle spécifique: chimie structurale, etc.
+  * Très peu d'entres elles contiennent une documentation utile, non seulement décrivant les applications et leur usage mais également capable d'assister l'utilisateur à répondre à ces questions.
+  * La plupart ne contiennent aucun outil de biologie intégrative ou de génomique/transcriptomique.
+  * Certaines d'entre elles ne semblent pas avoir de support actif.
+  * Certaines d'entre elles sont très spécialisées, demandant une grappe de calcul pour être utilisable (par exemple: Bio roll sur ROCKS).
+Après avoir évaluer ces solutions, nous en sommes venu à la conclusion que nous devions faire table rase et partir de zéro pour construire une installation bio-informatique Linux pour l'enseignement dans nos cours. Cette documentation se veut aussi pour nos étudiants un point de départ pour la construction d'un serveur de bio-informatique dans le cadre de leur travail.
+— //[[sylvain.foisy@diploide.net|foisys]] 2020/05/09 13:59//