Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:tree_structure [2022/08/12 10:30] – [Impilo - Installation de base] foisys
+++ fr:install:tree_structure [2024/06/11 16:44] (Version actuelle) – [Impilo - Installation de base] foisys
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+===== Impilo - Installation de base =====
+===== Arborescence du système de fichiers pour Impilo =====
+Pour ne pas être trop "unique", j'ai décidé de mettre tout le contenu spécifique à Impilo sous le répertoire ''/opt/bio''; sous ce répertoire, vous trouverez les items suivants:
+  * ''**/opt/bio/data**'': Tout les fichiers de données biologiques pertinents pour l'utilisation des applications Impilo (par exemple, les fichiers des bases de données BLAST).
+  * ''**/opt/bio/docs**'': Toute la documentation créée pour Impilo, incluant ce wiki. Consulter ces [[:fr:install:apache_config_impilo|instructions]] pour la configuration Apache spécifique à cette MV.
+  * ''**/opt/bio/sources**'': Où se trouvent toutes les applications bioinformatiques.
+===== Modifications de fichiers spécifiques du système de base =====
+==== Modifications à /etc/skel/.bashrc ====
+  * Retirer le caractère de commentaire de cette ligne pour permettre l'utilisation des couleurs sur la console:
+<sxh bash>
+#force_color_prompt=yes
+</sxh>
+devient
+<sxh bash>
+force_color_prompt=yes
+</sxh>
+  * Modifier ce bloc de sxh pour raccourcir l'affichage de la localisation dans le système de fichiers et enlever le vert comme couleur par défaut du prompt usager:
+<sxh bash>
+if [ "$color_prompt" = yes ]; then
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}[033[01;32m]u@\h[033[00m\]:[033[01;34m]w[033[00m]$ '
+else
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\w\$ '
+fi
+</sxh>
+devient
+<sxh bash>
+if [ "$color_prompt" = yes ]; then
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:[033[01;34m]W[033[00m]$'
+else
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\W\$ '
+fi
+</sxh>
+  * En dernier, retirer le commentaire de cette ligne pour accentuer l'affichage du contenu filtré par ''grep'':
+<sxh bash>
+#alias grep='grep --color=auto'
+</sxh>
+devient
+<sxh bash>
+alias grep='grep --color=auto'
+</sxh>
+  * Après tout ceci, copier ce fichier sous ''/home/bioubuntu''  pour donner ces caractéristiques à l'usager ''bioubuntu''. Tous les autres usagers l'auront par défaut.
+===== Modifications de fichiers spécifiques du système de base =====
+==== Modifications à /etc/skel/.bashrc ====
+  * Retirer le caractère de commentaire de cette ligne pour permettre l'utilisation des couleurs sur la console:
+<sxh bash>
+#force_color_prompt=yes
+</sxh>
+devient
+<sxh bash>
+force_color_prompt=yes
+</sxh>
+  * Modifier ce bloc ''bash'' pour raccourcir l'affichage de la localisation dans le système de fichiers et enlever le vert comme couleur par défaut du prompt usager:
+<sxh bash>
+if [ "$color_prompt" = yes ]; then
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}[033[01;32m]u@\h[033[00m\]:[033[01;34m]w[033[00m]$ '
+else
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\w\$ '
+fi
+</sxh>
+devient
+<sxh bash>
+if [ "$color_prompt" = yes ]; then
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:[033[01;34m]W[033[00m]$'
+else
+    PS1='${debian_chroot: ($debian_chroot)}\u@\h:\W\$ '
+fi
+</sxh>
+  * Après tout ceci, copier ce fichier sous ''/home/bioubuntu''  pour donner ces caractéristiques à l'usager ''bioubuntu''. Tous les autres usagers l'auront par défaut.
+==== Créer le fichier /etc/profile.d/impilo.sh ====
+Lorsqu'un usager se connecte à un serveur Ubuntu, le script qui crée la session pour cet usager lit les fichiers sous ''/etc/profile.d''  pour fixer certains paramètres de cette session, entre autre où trouver les applications disponibles. Pour garder la philosophie de garder Impilo pour lui-même, un fichier appelé ''/etc/profile.d/impilo.sh'' est créer pour y contenir les paramètres qui lui sont spécifiques:
+<sxh bash>
+% sudo touch /etc/profile.d/impilo.sh
+</sxh>