Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fr:install:bin_app_repository:trimmomatic [2021/05/29 15:35] – modification externe 127.0.0.1
+++ fr:install:bin_app_repository:trimmomatic [2025/05/15 16:25] (Version actuelle) – [Instructions d'installation] foisys
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+====== Trimmomatic ======
+===== Introduction =====
+  * Trimmomatic [(bolger_am_2014)] est une application qui permet de simultanément:
+    * Retirer les séquences FASTQ qui sont globalement de basse qualité;
+    * D'élaguer les portions de faible qualité des séquences FASTQ;
+    * De retirer les section des séquences qui sont des complémentaires aux amorces canoniques Illumina
+  * Trimmomatic est capable de filter des fichiers de séquences //paired-end// en retirant successivement les séquences de basse qualité dans chacun tout en préservant l'ordre et le pairage.
+===== Informations générales =====
+Site web: [[http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic|http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic]]
+License: [[http://www.gnu.org/licenses/lgpl.html|GNU LGPL v.3]]
+===== Instructions d'installation =====
+^  Version Impilo  ^  Version installée  |
+^ Impilo 24.04 A25  |  [[.:24_04_a25_build:trimmomatic_039|0.39]]  |
+===== Instruction d'usage =====
+  * Plus à venir...
+===== Références =====
+<refnotes>
+notes-separator : none
+</refnotes>