Différences

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fr:install:bin_app_repository:trimmomatic [2023/06/21 15:24] – [Instructions d'installation] foisysfr:install:bin_app_repository:trimmomatic [2025/05/01 15:48] (Version actuelle) – [Instructions d'installation] foisys
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 +====== Trimmomatic ======
  
 +===== Introduction =====
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 +  * Trimmomatic [(bolger_am_2014)] est une application qui permet de simultanément:
 +    * Retirer les séquences FASTQ qui sont globalement de basse qualité;
 +    * D'élaguer les portions de faible qualité des séquences FASTQ;
 +    * De retirer les section des séquences qui sont des complémentaires aux amorces canoniques Illumina
 +  * Trimmomatic est capable de filter des fichiers de séquences //paired-end// en retirant successivement les séquences de basse qualité dans chacun tout en préservant l'ordre et le pairage.  
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 +===== Informations générales =====
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 +Site web: [[http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic|http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic]]
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 +License: [[http://www.gnu.org/licenses/lgpl.html|GNU LGPL v.3]]
 +
 +===== Instructions d'installation =====
 +
 +^  Version Impilo  ^  Version installée  |
 +^ Impilo 24.04 A25  |  [[.:24_04_a25_build:trimmomatic_039|0.39]]  |
 +^ Impilo 22.04 A23  |  [[.:22_04_a23_build:trimmomatic_039|0.39]]  |
 +
 +===== Instruction d'usage =====
 +
 +  * Plus à venir...
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 +===== Références =====
 +<refnotes>
 +notes-separator : none
 +</refnotes>