Différences

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fr:install:bin_app_repository:emboss [2024/07/11 16:05] – [Instructions d'installation] foisysfr:install:bin_app_repository:emboss [2025/05/01 14:41] (Version actuelle) – [Instructions d'installation] foisys
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 +====== EMBOSS ======
  
 +===== Introduction =====
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 +La suite EMBOSS[(:ref:rice_p_2000)] est un ensemble d'outils capables d'effectuer une ensemble de tâches très diverses sur des séquences biologiques.
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 +===== Informations générales =====
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 +  * Site web: [[http://emboss.open-bio.org|http://emboss.open-bio.org]]
 +  * Le projet EMBOSS a épuisé son financement: cette situation a eu un impact majeur sur le fonctionnement/développement des outils du projet :-(
 +    * Mise à jour (14/07/2016): suite à un échange sur la liste de discussion, le site principal ci-dessus pointe maintenant vers le [[ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS|site FTP original]] contenant la dernière version du code source ;-)
 +    * Le code source est lentement migré vers GitHub: voir sur cette [[https://github.com/OryzaBioinformatics/emboss|page]]. Cependant, dans le moment (06/2022), il n'y a pas d'archive téléchargeable mais le lien sur emboss.open-bio.org fonctionne.
 +    * Les applications EMBASSY sont maintenant disponibles sur ce [[https://github.com/OryzaBioinformatics/embassy|site GitHub]].
 +  * License: Les libraries AJAX et NUCLEUS sont sous [[http://www.gnu.org/copyleft/lgpl.html|GNU LGPL v.3]]; les applications EMBOSS sont sous [[http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html| GNU GPL v.3]]
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 +===== Instructions d'installation =====
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 +^  Version Impilo  ^  Version installée  |
 +^  Impilo 24.04 A25  |  [[.:24_04_a25_build:emboss_660|6.6.0]]   |
 +^  Impilo 24.04 A24  |  [[.:24_04_a24_build:emboss_660|6.6.0]]   |
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 +===== Instructions d'usage =====
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 +  * Un petit tutoriel est disponible via cet article, écrit par Mullan et Bleasby[(:ref:mullan_lj_2002Mullan, L. J. & Bleasby, A., 2002. [[http://bib.oxfordjournals.org/content/3/1/92.long|Short EMBOSS User Guide.]] //Briefs Bioinform//, 3, pp.92-94.)]. Il date un peu mais la logique de base n'a pas changé de manière significative depuis cette époque :-)
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 +===== Références =====
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 +<refnotes> notes-separator : none </refnotes>
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 +===== Instructions d'usage =====
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 +  * Un petit tutoriel est disponible via cet article, écrit par Mullan et Bleasby[(:ref:mullan_lj_2002)]. Il date un peu mais la logique de base n'a pas changé de manière significative depuis cette époque :-)
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 +===== Références =====
 +<refnotes>
 +notes-separator : none
 +</refnotes>