Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:vienna_270 [2022/06/28 16:46] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:vienna_270 [2025/05/15 15:48] (Version actuelle) – foisys
Ligne 1: Ligne 1:
-====== Installation de ViennaRNA Package 2.5.1 ======+====== Installation de ViennaRNA Package 2.7.0 ======
  
 ===== Librairies additionnelles ===== ===== Librairies additionnelles =====
Ligne 12: Ligne 12:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo curl -L -O https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/download/sourcecode/2_5_x/ViennaRNA-2.5.1.tar.gz +% sudo curl -L -O https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/download/sourcecode/2_7_x/ViennaRNA-2.7.0.tar.gz 
-% sudo tar -zxvf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz +% sudo tar -zxvf ViennaRNA-2.7.0.tar.gz 
-% sudo rm -rf ViennaRNA-2.5.1.tar.gz+% sudo rm -rf ViennaRNA-2.7.0.tar.gz
 </sxh> </sxh>
  
     * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.     * Ce dossier devrait appartenir à ''root''. Les permissions de ce dossier devraient être ''755''.
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./ViennaRNA-2.5.1 +% sudo chown -R root:root ./ViennaRNA-2.7.0 
-% sudo chmod 755 ./ViennaRNA-2.5.1+% sudo chmod 755 ./ViennaRNA-2.7.0
 </sxh> </sxh>
  
-    * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''./ViennaRNA-2.5.1'', la compilation se fait simplement:+    * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''./ViennaRNA-2.7.0'', la compilation se fait simplement:
  
 <sxh bash> <sxh bash>
-% cd ./ViennaRNA-2.5.1+% cd ./ViennaRNA-2.7.0
 % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
 </sxh> </sxh>
  
-    * La commande ''sudo make install'' crée un répertoire ''/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin'' qui contient les exécutables; il faut éditer le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' en y ajoutant ces lignes à la toute fin:+    * La commande ''sudo make install'' crée un répertoire ''/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.7.0/bin'' qui contient les exécutables; il faut éditer le fichier ''/etc/profile.d/impilo.sh'' en y ajoutant ces lignes à la toute fin:
  
 <sxh bash> <sxh bash>
Ligne 36: Ligne 36:
 # ViennaRNA Package specific environment variables # ViennaRNA Package specific environment variables
 # #
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.5.1/bin+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/ViennaRNA-2.7.0/bin
 </sxh> </sxh>