Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:picard_340 [2023/06/21 15:32] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:picard_340 [2025/05/15 16:38] (Version actuelle) foisys
Ligne 12: Ligne 12:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo mkdir picard-3.0 +% sudo mkdir picard-3.4.0 
-% cd picard-3.0 +% cd picard-3.4.0 
-% sudo curl -L -O https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/3.0.0/picard.jar+% sudo curl -L -O https://github.com/broadinstitute/picard/releases/download/3.4.0/picard.jar
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 27: Ligne 27:
 <sxh bash> <sxh bash>
 #!/bin/bash #!/bin/bash
-java -jar ./picard.jar $@+java -jar /opt/bio/sources/picard-3.4.0/picard.jar $@
 </sxh>  </sxh> 
  
Ligne 42: Ligne 42:
 # Picard specific environment variables # Picard specific environment variables
 # #
-export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/picard-3.0+export PATH=:$PATH:/opt/bio/sources/picard-3.4.0
 </sxh> </sxh>