Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:muscle_53 [2024/07/11 15:52] – créée - modification externe 127.0.0.1fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:muscle_53 [2025/05/15 15:03] (Version actuelle) – [.Librairies additionnelles] foisys
Ligne 1: Ligne 1:
 +====== Installation de MUSCLE 5.3 ======
 +
 +===== Librairies additionnelles =====
 +
 +  * Aucune librairie additionnelle nécessaire si les librairies nécessaire pour la compilation sont installées.
 ===== Procédure ===== ===== Procédure =====
  
 Voici la procédure suivi pour l'installation de MUSCLE à partir du code source: Voici la procédure suivi pour l'installation de MUSCLE à partir du code source:
  
-  * L'archive du code source a été téléchargé du site web et décompressé dans un dossier appelé ''muscle_3.8.1551'':+  * L'archive du code source a été téléchargé du site web et décompressé dans un dossier appelé ''muscle-5.3'':
  
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo curl -L -o muscle-5.1.tar.gz https://github.com/rcedgar/muscle/archive/refs/tags/v5.1.tar.gz +% sudo curl -L -o muscle-5.3.tar.gz https://github.com/rcedgar/muscle/archive/refs/tags/v5.3.tar.gz 
-% sudo tar -zxvf muscle-5.1.tar.gz +% sudo tar -zxvf muscle-5.3.tar.gz 
-% sudo rm -rf muscle-5.1.tar.gz+% sudo rm -rf muscle-5.3.tar.gz
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 15: Ligne 20:
  
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./muscle-5.1 +% sudo chown -R root:root ./muscle-5.3 
-% sudo chmod 755 ./muscle-5.1+% sudo chmod 755 ./muscle-5.3
 </sxh> </sxh>
  
-  * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''/opt/bio/sources/muscle-5.1/src'', la compilation se fait simplement: +  * Une fois qu'on se retrouve dans le dossier ''/opt/bio/sources/muscle-5.3/src'', la compilation se fait simplement:
- +
-<sxh bash> +
-% cd muscle-5.1/src +
-% sudo make +
-</sxh>+
  
-  * Pour une utilisation par tout ceux qui pourrait l'utiliser, simplement créer un répertoire ''bin'' dans ''muscle-5.1'', créer un lien symbolique: 
 <sxh bash> <sxh bash>
-% cd .. +% cd muscle-5.3/src 
-% sudo mkdir ./bin +% sudo bash build_linux.bash
-% sudo ln -s /opt/bio/sources/muscle-5.1/src/Linux/muscle /opt/bio/sources/muscle-5.1/bin/muscle+
 </sxh> </sxh>
  
Ligne 38: Ligne 36:
 # MUSCLE specific environment variable # MUSCLE specific environment variable
 # #
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/muscle-5.1/bin+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/muscle-5.3/bin
 </sxh> </sxh>