Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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fr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:jellyfish_231 [2025/05/19 07:33] – [Installation de Jellyfish 2.3.0] foisysfr:install:bin_app_repository:24_04_a25_build:jellyfish_231 [2025/05/19 07:34] (Version actuelle) – foisys
Ligne 10: Ligne 10:
 <sxh bash> <sxh bash>
 % cd /opt/bio/sources % cd /opt/bio/sources
-% sudo curl -L -O https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases/download/v2.3.0/jellyfish-2.3.0.tar.gz +% sudo curl -L -O https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases/download/v2.3.1/jellyfish-2.3.1.tar.gz 
-% sudo tar -zxvf jellyfish-2.3.0.tar.gz +% sudo tar -zxvf jellyfish-2.3.1.tar.gz 
-% sudo rm -rf jellyfish-2.3.0.tar.gz+% sudo rm -rf jellyfish-2.3.1.tar.gz
 </sxh> </sxh>
  
-  * Il faut s'assurer que le répertoire ''jellyfish-2.3.0'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions:+  * Il faut s'assurer que le répertoire ''jellyfish-2.3.1'' appartient à ''root'' avec les bonnes permissions:
 <sxh bash> <sxh bash>
-% sudo chown -R root:root ./jellyfish-2.3.0 +% sudo chown -R root:root ./jellyfish-2.3.1 
-% sudo chmod 755 ./jellyfish-2.3.0+% sudo chmod 755 ./jellyfish-2.3.1
 </sxh> </sxh>
  
   * On procède à la compilation grâce au ballet habituel:   * On procède à la compilation grâce au ballet habituel:
 <sxh bash> <sxh bash>
-% cd jellyfish-2.3.0+% cd jellyfish-2.3.1
 % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install % sudo ./configure --prefix=`pwd` && sudo make && sudo make install
 </sxh> </sxh>
Ligne 32: Ligne 32:
 # Bedtools specific environment variables # Bedtools specific environment variables
 # #
-export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jellyfish-2.3.0/bin+export PATH=$PATH:/opt/bio/sources/jellyfish-2.3.1/bin
 </sxh> </sxh>